More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0002 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
377 aa  761  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
377 aa  761  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  93.37 
 
 
377 aa  717  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  53.56 
 
 
379 aa  417  1e-115  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.3 
 
 
379 aa  415  1e-115  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.3 
 
 
379 aa  415  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  54.07 
 
 
381 aa  416  1e-115  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  54.07 
 
 
381 aa  416  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  53.3 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.89 
 
 
378 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.3 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 
381 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  53.03 
 
 
379 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.03 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 
381 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.12 
 
 
378 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.62 
 
 
380 aa  328  1e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  44.74 
 
 
376 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.73 
 
 
378 aa  302  6e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  38.62 
 
 
378 aa  295  9e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.36 
 
 
378 aa  290  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.68 
 
 
380 aa  282  6e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
376 aa  275  1e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37 
 
 
374 aa  274  2e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
376 aa  274  2e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0623e-09 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
376 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
376 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
376 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  38.1 
 
 
376 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 
376 aa  269  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 
376 aa  266  3e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  36.68 
 
 
376 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  36.15 
 
 
376 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  4.91978e-05 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.57 
 
 
374 aa  256  5e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  3.74529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.09 
 
 
370 aa  253  4e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.77 
 
 
367 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.22 
 
 
366 aa  240  3e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.22 
 
 
366 aa  240  3e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.8 
 
 
365 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.58 
 
 
370 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.24 
 
 
366 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.03 
 
 
370 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  33.87 
 
 
366 aa  220  2e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.75 
 
 
367 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 
376 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 
367 aa  199  8e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.5 
 
 
372 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 
366 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 
372 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.55 
 
 
378 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 
378 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 
389 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.03 
 
 
366 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.55 
 
 
378 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.39 
 
 
378 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.3 
 
 
374 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
372 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
372 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  31.04 
 
 
377 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.59 
 
 
377 aa  185  1e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 
365 aa  184  2e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.92 
 
 
372 aa  184  2e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  2.75643e-08  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  31.05 
 
 
370 aa  183  4e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 
369 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.87 
 
 
372 aa  182  8e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 
367 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.28 
 
 
375 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.32 
 
 
373 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.19 
 
 
387 aa  181  3e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 
365 aa  179  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 
374 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.92 
 
 
397 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 
372 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 
385 aa  175  1e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.66 
 
 
385 aa  175  1e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
390 aa  175  1e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.37 
 
 
373 aa  175  1e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  29.4 
 
 
397 aa  175  1e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.33 
 
 
369 aa  174  3e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.51 
 
 
382 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.75 
 
 
374 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 
394 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.5 
 
 
372 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
373 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 
373 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
375 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 
373 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 
366 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.12219e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
375 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  29.54 
 
 
381 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.66783e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  29.92 
 
 
372 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 
372 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.44 
 
 
373 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  29.14 
 
 
366 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.97729e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 
373 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.35 
 
 
372 aa  167  3e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 
373 aa  167  3e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.93 
 
 
366 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
375 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>