216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3967 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  55.84 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  60.63 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  51.68 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  52.35 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  52.35 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 140 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  57.14 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  52.05 
 
 		 143 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  54.55 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  56.67 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  49.23 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  49.23 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  51.45 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  52.63 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  54.47 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  51.22 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  53.72 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  49.03 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  49.03 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  53.28 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  47.33 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  50.4 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  46.83 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  49.18 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  51.52 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  48.39 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  46.09 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  51.22 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  47.06 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  51.24 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  46.32 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  55 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  46.32 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  48.78 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  48.41 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  47.73 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  54.17 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  53.23 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 142 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  50.4 
 
 		 133 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  48 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  52.17 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  49.62 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  47.33 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  50.81 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  41.25 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  50.81 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  48.91 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  47.06 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  52.1 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>