21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3916 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3750  hypothetical protein  44.3 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  35.9 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  50.94 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  46.67 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  35.21 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  41.27 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  32.73 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  32.73 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  39.39 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  39.39 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  40 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  33.85 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  30.77 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  35.38 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  41.82 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>