More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3907 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  56.2 
 
 		 285 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  41.78 
 
 		 289 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  43.57 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  44.14 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  44.56 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  42.86 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  42.26 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  40.21 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  37.6 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  39.79 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  30.69 
 
 		 408 aa  99.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 257 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 		 2762 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  30.23 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.9 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.03 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  41.07 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  29.21 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  24.91 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  39.29 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.9 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  27.01 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  25.84 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  27.38 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  31.73 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  26.48 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  25.84 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  27.15 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>