More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3871 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 832 aa  1706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 755 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  37.94 
 
 		 790 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 790 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 792 aa  502  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 803 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 761 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 867 aa  458  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 807 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 860 aa  445  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 859 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  36.37 
 
 		 780 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 780 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 776 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 851 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 761 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 856 aa  337  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 765 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 753 aa  310  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 775 aa  306  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 745 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 784 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 758 aa  290  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 758 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 758 aa  289  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 758 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 783 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 774 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 792 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 780 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 794 aa  263  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 759 aa  261  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 722 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 785 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 749 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 741 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 796 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 809 aa  253  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 755 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 825 aa  247  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 806 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 728 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 764 aa  240  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 771 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 809 aa  237  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 796 aa  237  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 817 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 777 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 789 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 896 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 764 aa  232  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 729 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 775 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 784 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 919 aa  227  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 732 aa  227  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 773 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 770 aa  223  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 782 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 773 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 771 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 748 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 737 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 762 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 755 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 796 aa  214  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 730 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 808 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 903 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 747 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 839 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 722 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 790 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 		 763 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 862 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 771 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 746 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 787 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 824 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 779 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 720 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 795 aa  201  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 767 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 880 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 754 aa  199  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 857 aa  197  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 766 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>