206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3830 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  50.8 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  50.32 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  54.91 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  49.67 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  52.17 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  49.34 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  49.01 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  51.16 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  48.01 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  50.83 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  50.83 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  48.87 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  48.23 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  50.83 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  48.2 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  50.5 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  50.5 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  50.5 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  50.5 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  50.5 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  50.33 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  49.5 
 
 		 302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  50.33 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  50.33 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  49.34 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  49.83 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  49.83 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  47.59 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  47.18 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  48.16 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  49.2 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.41 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  48.87 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  47.91 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  47.1 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  47.59 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  44.77 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  47.02 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  47.18 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  47.02 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  48.95 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  48.95 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  44.98 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.15 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  45.05 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.81 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  45.96 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  45.83 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  44.48 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  44.27 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  46.55 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  46.43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.35 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.24 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  31.44 
 
 		 253 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.06 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.8 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.68 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.2 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.1 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.09 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.69 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.59 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  34.57 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.82 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  37.27 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.43 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  30.83 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.18 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  32.58 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.95 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.92 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  31.18 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.92 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.1 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  30.99 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  31.06 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.06 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  29.92 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.1 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.99 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  29.44 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.2 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  29.63 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.17 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  28.17 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.99 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.41 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.95 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  29.02 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>