46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3804 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  100 
 
 		 710 aa  1471    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  100 
 
 		 710 aa  1471    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  100 
 
 		 710 aa  1471    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  25.81 
 
 		 498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  27.3 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  24.25 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  29.09 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  24.84 
 
 		 721 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 721 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  22.46 
 
 		 675 aa  67  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 737 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  22.22 
 
 		 701 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  22.22 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 739 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  24.83 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  31.09 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  24.58 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  25.64 
 
 		 461 aa  54.7  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  23.95 
 
 		 426 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 663 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  23.16 
 
 		 538 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  23.76 
 
 		 373 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 373 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>