More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3784 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  100 
 
 
496 aa  997    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.59 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
510 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
650 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  39.45 
 
 
529 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
1043 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  36.82 
 
 
586 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
816 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
535 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  40.25 
 
 
535 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
564 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
1406 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
1066 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
535 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
535 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
644 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
1516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
1484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
1258 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
383 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
1138 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
1259 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
930 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1171 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  36.08 
 
 
696 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
475 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
1178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
533 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
884 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
708 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
1741 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
679 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
733 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
591 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
300 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
701 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
728 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
625 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.73 
 
 
486 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
405 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
1383 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
524 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
389 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
389 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
815 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
614 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
421 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
474 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  33.76 
 
 
300 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.93 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
528 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
709 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
498 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
342 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  26.38 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  33.33 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
969 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
718 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
920 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
695 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  36.07 
 
 
551 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
639 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
377 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
682 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  32.67 
 
 
400 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
1291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  28.43 
 
 
829 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
477 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
1711 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
679 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
592 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
407 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
621 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
1390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
1390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>