More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3767 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1033    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  53.31 
 
 		 511 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.58 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  50.2 
 
 		 510 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.45 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.51 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.51 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.51 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  46.89 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.33 
 
 		 483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.12 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.72 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 		 489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.72 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  47.44 
 
 		 510 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  48.55 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.88 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.69 
 
 		 523 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.05 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.51 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  44.97 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.85 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  38.46 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  38.43 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  37.31 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 		 544 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  36.36 
 
 		 560 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  35.9 
 
 		 560 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  39.18 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  34.59 
 
 		 565 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  35.53 
 
 		 560 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  35.34 
 
 		 560 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  35.26 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  35.47 
 
 		 546 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  35.51 
 
 		 562 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 513 aa  319  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  36.22 
 
 		 546 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  35.69 
 
 		 564 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 540 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 574 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  36.02 
 
 		 546 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 540 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 540 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  37.97 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.94 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  37.88 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  34.4 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.89 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.27 
 
 		 579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  36.82 
 
 		 538 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 557 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 1043 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 843 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 554 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 		 570 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 		 570 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 		 570 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  36.82 
 
 		 538 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 541 aa  309  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  34.33 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  37.24 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  36.73 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 550 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  33.84 
 
 		 570 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  37.43 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  34.82 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  35.82 
 
 		 570 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 566 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  36.7 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 571 aa  303  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  34.08 
 
 		 570 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  37.5 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  34.94 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  33.65 
 
 		 574 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 513 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  34.78 
 
 		 578 aa  300  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  31.71 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  34.07 
 
 		 572 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  34.7 
 
 		 546 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>