More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3749 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  100 
 
 
254 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3623  short chain dehydrogenase  57.26 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
261 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  52.46 
 
 
252 aa  222  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
257 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  51.41 
 
 
259 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  49.01 
 
 
262 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2066  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 
251 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
244 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
244 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
244 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
267 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  47.11 
 
 
265 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1386  short chain dehydrogenase  51.63 
 
 
256 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  48.25 
 
 
259 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2830  short chain dehydrogenase  48.44 
 
 
247 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1491  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
233 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
256 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2633  short chain dehydrogenase  50 
 
 
252 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522404  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  45.53 
 
 
256 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
266 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
266 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.32 
 
 
256 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
256 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
257 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
255 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.76 
 
 
245 aa  142  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.76 
 
 
251 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
249 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.37 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
258 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
257 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.43 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
257 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
255 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
253 aa  138  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
247 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
253 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
260 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
262 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
269 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 
263 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
249 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
255 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
275 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  37.6 
 
 
258 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
252 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.9 
 
 
260 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.62 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2849  glucose 1-dehydrogenase  38.21 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  38.28 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
252 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
254 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
254 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.17 
 
 
238 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
257 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  37.05 
 
 
263 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
245 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
248 aa  135  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
254 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
282 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1271  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.93 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.668655  normal  0.576279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  36.11 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  35.18 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  34 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.61 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  36.11 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  34 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>