More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3744 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1522    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 765 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 761 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 780 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 761 aa  326  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 755 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 803 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 792 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 794 aa  304  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 704 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 790 aa  297  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 775 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 832 aa  287  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 749 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 786 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 784 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 776 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 745 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 737 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 722 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 758 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 743 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 771 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 734 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 728 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 741 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 763 aa  253  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 787 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 758 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 720 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 759 aa  250  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 780 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 736 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 743 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  30.66 
 
 		 751 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 774 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 792 aa  244  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 725 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 747 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 776 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 751 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 717 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 756 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 804 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 722 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 728 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 817 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 746 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 730 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 695 aa  228  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 780 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 764 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 796 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 713 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 754 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 779 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 724 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 723 aa  223  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 785 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 759 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 726 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 730 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 777 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 744 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 780 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 764 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 769 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 775 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 757 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 856 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.61 
 
 		 755 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 848 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 784 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 770 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 764 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 720 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 825 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 771 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 748 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 851 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 855 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 758 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>