More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3731 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
327 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
274 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
291 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
280 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
291 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
281 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
282 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
300 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
271 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  40.66 
 
 
274 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  38 
 
 
283 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
274 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
267 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
277 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  36.76 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
272 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
268 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
273 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
275 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
285 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
276 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
307 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
279 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
307 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
274 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 
285 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.23 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
293 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  42.55 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  32.56 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
281 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 
272 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.8 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0220  putative oxidoreductase NAD-/NADP-dependent  38.36 
 
 
277 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  39.23 
 
 
287 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
292 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
268 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 
280 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
287 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
286 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
271 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
276 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
281 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
268 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
277 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
278 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
290 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
272 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>