27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3722 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3526  hypothetical protein  48.65 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  44.67 
 
 
168 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0286  hypothetical protein  44.23 
 
 
167 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.549587  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0305  hypothetical protein  43.59 
 
 
167 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0295  hypothetical protein  42.36 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4543  hypothetical protein  41.57 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4750  hypothetical protein  39.73 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.881143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3367  hypothetical protein  41.82 
 
 
184 aa  94  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0911  hypothetical protein  35.26 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00698332  normal  0.109988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  37.59 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  35.25 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  33.11 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.06 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  27.48 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.06 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  30.95 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  32.28 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  33.7 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  32.14 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  32.06 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  28.38 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  28.8 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  28.37 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  30.69 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.96 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>