31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3720 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  53.73 
 
 		 141 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3331  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  63.96 
 
 		 120 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  49.26 
 
 		 153 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5806  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  39.32 
 
 		 119 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3492  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.662132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1862  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.530634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  35.94 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4490  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.52 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2009  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.97 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2530  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.04 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3831  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.82 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  27.52 
 
 		 157 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3325  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.57 
 
 		 189 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151498  hitchhiker  0.000641272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3852  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  24.19 
 
 		 136 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0818324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2840  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.14 
 
 		 111 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  34.45 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3492  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.68 
 
 		 111 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.51 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0370  hypothetical protein  34.82 
 
 		 113 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5271  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.97 
 
 		 113 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0018  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  26.05 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  29.92 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0353  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.97 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  0.260542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  31.94 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  31.75 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>