More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3713 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 854 aa  1763    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 775 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 777 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 795 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 798 aa  297  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 676 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 856 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 817 aa  244  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 720 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 739 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 775 aa  222  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 792 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 790 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 704 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 784 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 761 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 784 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 790 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 765 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 730 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 817 aa  203  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 780 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 755 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 785 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 780 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 744 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 796 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 763 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 803 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 794 aa  188  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 741 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 755 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 730 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 776 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 730 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 710 aa  183  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 729 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 867 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 807 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 802 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 763 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 832 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 795 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 769 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 738 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 743 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 764 aa  170  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 771 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 732 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 809 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 812 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 782 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 773 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 779 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 743 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 777 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 723 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 722 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 730 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 790 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 796 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 804 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 822 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 937 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 771 aa  157  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 851 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 753 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 764 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 773 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 808 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 724 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 749 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 850 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 773 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 733 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 862 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 807 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 825 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 737 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 751 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 717 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 762 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 778 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 808 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  26.54 
 
 		 797 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 763 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 783 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 780 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 758 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>