More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3670 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  814    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  53.66 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  55.5 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  55.26 
 
 
432 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  53.92 
 
 
435 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  53.9 
 
 
423 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  54.05 
 
 
435 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  54.15 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  50.72 
 
 
472 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  49.4 
 
 
434 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  50.72 
 
 
472 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  49.28 
 
 
433 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  49.4 
 
 
434 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  50.72 
 
 
432 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  53.9 
 
 
443 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  49.4 
 
 
433 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  53.66 
 
 
423 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  53.66 
 
 
423 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  49.16 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  49.4 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  48.92 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  50.96 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  49.88 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  50.72 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  50.72 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  50.72 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  50 
 
 
432 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  50.72 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  49.39 
 
 
433 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  52.93 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  47.32 
 
 
429 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  44.84 
 
 
434 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  44.84 
 
 
434 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  44.84 
 
 
434 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  44.84 
 
 
434 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  44.6 
 
 
434 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  49.14 
 
 
436 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  49.25 
 
 
433 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  48.65 
 
 
436 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  49.87 
 
 
430 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 
430 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  42.89 
 
 
425 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  42.89 
 
 
425 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  46.62 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  45.28 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
436 aa  338  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  44.55 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  44.55 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  44.55 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
436 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  41.67 
 
 
433 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
433 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  39.95 
 
 
452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  39.95 
 
 
452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.25 
 
 
428 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.97 
 
 
441 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  37.1 
 
 
433 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
434 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
426 aa  235  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  33.9 
 
 
424 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
431 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  36.12 
 
 
424 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.52 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 
430 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
439 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
425 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  35.84 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
449 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  32.19 
 
 
440 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
431 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
441 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  30.68 
 
 
424 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  31.15 
 
 
429 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  31.76 
 
 
430 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  32.17 
 
 
441 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  32.26 
 
 
480 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  32.26 
 
 
441 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
415 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  31.02 
 
 
430 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  31.02 
 
 
430 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  31.23 
 
 
430 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  32.26 
 
 
441 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  31.23 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  31.67 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  31.17 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  32.34 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
454 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  31.59 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  31.45 
 
 
439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  31.44 
 
 
442 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  31.41 
 
 
445 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
429 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  31.28 
 
 
432 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  31.35 
 
 
468 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>