107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3595 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 381 aa  750    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  38.15 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  33.16 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  32.98 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  26.46 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 586 aa  76.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  30.58 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  25.51 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  29.63 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.8 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 416 aa  69.3  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.19 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.21 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  31.53 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  22.37 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  52.31 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  28.08 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  38.61 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.48 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  25.4 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  32.99 
 
 		 280 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.8 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.65 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  39.44 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.8 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  44.23 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 363 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  27.27 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.82 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 178 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 178 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.66 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 325 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>