52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3538 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  35.34 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  34.75 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  33.6 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.4 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  34.4 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  34.62 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  33.87 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.31 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  33.08 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.85 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  32.12 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  30.22 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  34.35 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  31.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  32.82 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  28.1 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  31.01 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  29.79 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  31.06 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  29.08 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.71 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.79 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  28.35 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  30.37 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  34.88 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2372  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  39.06 
 
 		 185 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5802  hypothetical protein  27.34 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  25.6 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  26.77 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3900  hypothetical protein  27.5 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>