59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3531 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  36.53 
 
 
181 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  33.91 
 
 
182 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34 
 
 
172 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.94 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  32.53 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  29.7 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  35.11 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  34.23 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  33.76 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  33.76 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  33.76 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  29.93 
 
 
180 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  30.28 
 
 
177 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  33.12 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  33.59 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  32.89 
 
 
139 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  31.3 
 
 
178 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  33.13 
 
 
183 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  62.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  30.46 
 
 
221 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  28.86 
 
 
178 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  32.23 
 
 
181 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  32.19 
 
 
189 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  32.81 
 
 
182 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  33.6 
 
 
138 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  32.43 
 
 
222 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.21 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  34.45 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  28.3 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.08 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  28.12 
 
 
156 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  29.17 
 
 
192 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  27.22 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  28.09 
 
 
190 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  27.71 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  32.26 
 
 
135 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  32.5 
 
 
133 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  26.98 
 
 
151 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  26.42 
 
 
166 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  26.25 
 
 
165 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.05 
 
 
158 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  30.17 
 
 
151 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  30.53 
 
 
168 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.36 
 
 
146 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  26.67 
 
 
150 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.97 
 
 
135 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.97 
 
 
135 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>