More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3529 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 236 aa  98.2  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  40.46 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  35.77 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  50.67 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  41.6 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  52.38 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 414 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 87 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>