20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3527 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  47.52 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  27.41 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  27.41 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  27.41 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.93 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  28.36 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  27.48 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.574385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.2 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.2 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.2 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.47 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.24 
 
 		 145 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  28.08 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  28.47 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  30.22 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>