More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3493 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  67.8 
 
 		 2010 aa  2128    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.8 
 
 		 1937 aa  2307    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  65.4 
 
 		 1390 aa  729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.73 
 
 		 1937 aa  2296    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  56.01 
 
 		 1392 aa  1405    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.03 
 
 		 1179 aa  1056    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.65 
 
 		 1406 aa  1337    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.56 
 
 		 1479 aa  1618    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.44 
 
 		 1896 aa  2146    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  68.99 
 
 		 1937 aa  2308    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.95 
 
 		 1917 aa  2194    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.77 
 
 		 2107 aa  1894    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.99 
 
 		 1588 aa  1463    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.21 
 
 		 1303 aa  1223    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.61 
 
 		 1159 aa  1019    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.6 
 
 		 1853 aa  1800    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.03 
 
 		 1406 aa  1208    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.45 
 
 		 1857 aa  1864    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.47 
 
 		 1847 aa  1795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.93 
 
 		 2099 aa  2053    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.31 
 
 		 1119 aa  1055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.83 
 
 		 1482 aa  1439    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  73.58 
 
 		 590 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  74.44 
 
 		 1942 aa  2394    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.39 
 
 		 1150 aa  1159    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.2 
 
 		 1792 aa  1763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.68 
 
 		 1839 aa  1872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.54 
 
 		 1843 aa  1797    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.88 
 
 		 1816 aa  2212    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.93 
 
 		 2099 aa  2051    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1782 aa  3573    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.61 
 
 		 1458 aa  1391    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.59 
 
 		 1936 aa  2309    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 		 1214 aa  1100    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  51.68 
 
 		 1179 aa  1036    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  62.8 
 
 		 1695 aa  1676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.51 
 
 		 1400 aa  1195    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.59 
 
 		 1964 aa  2125    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.72 
 
 		 2037 aa  1990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.02 
 
 		 1478 aa  1273    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.16 
 
 		 1954 aa  2168    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.91 
 
 		 1468 aa  1565    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  57.35 
 
 		 1297 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1195 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 1155 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1713 aa  520  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1680 aa  506  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  38.53 
 
 		 1137 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  61.63 
 
 		 1118 aa  484  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  35.72 
 
 		 1158 aa  485  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  36.62 
 
 		 1161 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1038 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 922 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1137 aa  480  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 1278 aa  480  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1356 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1159 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1168 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1216 aa  466  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1203 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1143 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1141 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1158 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 916 aa  453  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1161 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1145 aa  450  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.86 
 
 		 1200 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1195 aa  447  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1163 aa  447  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 920 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1149 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1165 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1158 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1155 aa  440  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1177 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1155 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.88 
 
 		 1170 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  33.44 
 
 		 1172 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1194 aa  434  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1201 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.18 
 
 		 1196 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1131 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1155 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  31.71 
 
 		 1374 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1189 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  35.02 
 
 		 896 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 944 aa  407  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  34.23 
 
 		 896 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1142 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 1162 aa  403  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  34.94 
 
 		 896 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 896 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  34.94 
 
 		 896 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 		 896 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  35.31 
 
 		 896 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  35.06 
 
 		 896 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 896 aa  393  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 896 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1037 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1361 aa  343  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>