More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3473 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 786 aa  1609    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 780 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 753 aa  270  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 794 aa  266  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 761 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 825 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 726 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 722 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 710 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 765 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 730 aa  237  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 790 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 804 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 785 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 736 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 725 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 761 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 729 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 817 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 792 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.92 
 
 		 739 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 748 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 720 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 704 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 722 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 790 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 780 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 759 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 733 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 732 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 751 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 771 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 771 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 743 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 809 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 784 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 724 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 723 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 856 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 775 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 728 aa  201  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 730 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 749 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 774 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 695 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 799 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 858 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 717 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 746 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 755 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 919 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 757 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 808 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 720 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 743 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 766 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 731 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 713 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 758 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 779 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 728 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 747 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 776 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 754 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 771 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 873 aa  187  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 788 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 690 aa  185  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 763 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 783 aa  184  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 747 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 731 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 690 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 700 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 737 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 757 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.1 
 
 		 751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 764 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 777 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 767 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 762 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>