More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3440 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  39.77 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  35.58 
 
 		 409 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  29.87 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  30.19 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  29.56 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  28.38 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.66 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.1 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  22.73 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  21.8 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  27.88 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 483 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 483 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  25.44 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.62 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.87 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  23.32 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.32 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.32 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.48 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  26.16 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.67 
 
 		 479 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.07 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.67 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  30.95 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 243 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.59 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 534 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  30.23 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  30.23 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  30.23 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  30.23 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 592 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  24.85 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.14 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.14 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.12 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.88 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  26.96 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.14 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>