More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3316 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  100 
 
 
467 aa  930    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  63.38 
 
 
460 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  62.1 
 
 
460 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  57.08 
 
 
472 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  53.81 
 
 
467 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  54.78 
 
 
469 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  45.37 
 
 
468 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.66 
 
 
463 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  44.75 
 
 
469 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  42.22 
 
 
450 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  43.88 
 
 
854 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  45.9 
 
 
469 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  43.65 
 
 
868 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  43.33 
 
 
881 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  43.65 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  43.3 
 
 
485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  44.62 
 
 
486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  41.44 
 
 
447 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  44.32 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  42.98 
 
 
461 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  43.18 
 
 
461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  42.98 
 
 
463 aa  352  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  41.16 
 
 
464 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  41.94 
 
 
449 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  42.41 
 
 
456 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  41.69 
 
 
464 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  42.02 
 
 
462 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  41.16 
 
 
464 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  43.85 
 
 
463 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  43.02 
 
 
472 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  40.18 
 
 
458 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  42.41 
 
 
456 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  43.14 
 
 
462 aa  349  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  43.78 
 
 
461 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  44.42 
 
 
488 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  41.48 
 
 
462 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  43.85 
 
 
466 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  43.62 
 
 
465 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  42.57 
 
 
456 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  42.7 
 
 
462 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  40.58 
 
 
455 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  42.19 
 
 
456 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  44.12 
 
 
462 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  43.62 
 
 
466 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  40.4 
 
 
471 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  45.23 
 
 
464 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  42.51 
 
 
465 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  42.61 
 
 
475 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  43.18 
 
 
465 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  41.89 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  40.4 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  44.04 
 
 
464 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  43.18 
 
 
464 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  43.3 
 
 
489 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  43.3 
 
 
489 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.3 
 
 
464 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  39.82 
 
 
462 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  43.84 
 
 
863 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  44.59 
 
 
467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  42.06 
 
 
465 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.75 
 
 
464 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  43.08 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  43.08 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.08 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.08 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  42.83 
 
 
782 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.3 
 
 
464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.3 
 
 
464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  39.82 
 
 
462 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.3 
 
 
472 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  42.41 
 
 
464 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  44.15 
 
 
460 aa  336  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  42.02 
 
 
460 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  37.94 
 
 
461 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  42.38 
 
 
782 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  42.38 
 
 
453 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  39.56 
 
 
461 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.3 
 
 
961 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  38.02 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  40.09 
 
 
458 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  40.31 
 
 
469 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  39.56 
 
 
457 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  41.99 
 
 
469 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  43.13 
 
 
479 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  39.96 
 
 
474 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  37.42 
 
 
475 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  38.56 
 
 
462 aa  316  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  41.01 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  37.93 
 
 
830 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  38.88 
 
 
457 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  40.5 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  36.98 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0695  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.24 
 
 
462 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  39.24 
 
 
459 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1594  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.44 
 
 
456 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1406  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.44 
 
 
456 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  39.46 
 
 
469 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1740  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.11 
 
 
456 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  38.34 
 
 
468 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0256  phosphohexosemutase  35 
 
 
455 aa  266  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.769457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>