More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3305 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  61.19 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  60.1 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  47.3 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  47.77 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  42.92 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  34.76 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 309 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 449 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.32 
 
 		 381 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.84 
 
 		 320 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.15 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  34.08 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.42 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  34.73 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 734 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.64 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.17 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 567 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.41 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.05 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.34 
 
 		 521 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.72 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 401 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 		 862 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.75 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.54 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.54 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.88 
 
 		 706 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  35.57 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.38 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.05 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.61 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 		 870 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  29.15 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25.61 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  32.95 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25.61 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.17 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  31.46 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 493 aa  68.2  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  25.44 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.65 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.32 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 949 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 		 440 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 903 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  27.89 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.37 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 976 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.68 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.44 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  34.41 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>