More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3280 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1439    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 		 735 aa  626  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 		 724 aa  475  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  40.27 
 
 		 755 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 693 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 719 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 		 705 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  39.29 
 
 		 771 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  39.5 
 
 		 755 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  39.3 
 
 		 756 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 719 aa  324  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 792 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 707 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 715 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 694 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 706 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 706 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 770 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 710 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 734 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.48 
 
 		 695 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 745 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 757 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 709 aa  260  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 860 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 753 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  30.27 
 
 		 753 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 736 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 747 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 700 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 712 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 733 aa  251  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 747 aa  250  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  30.95 
 
 		 772 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 748 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 769 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 747 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 742 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 742 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 656 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 749 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 751 aa  244  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 747 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 747 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 733 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 748 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 733 aa  240  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 726 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 733 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 689 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 759 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  28.13 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 773 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 749 aa  231  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 821 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 753 aa  230  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 698 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  30.34 
 
 		 680 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 730 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 730 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 759 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 711 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 731 aa  227  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 731 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 826 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 731 aa  223  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 708 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 768 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 699 aa  221  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 837 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 780 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 708 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 724 aa  219  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 740 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  29.96 
 
 		 765 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 815 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 760 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  28.08 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  28.08 
 
 		 760 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>