266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3262 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  60 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  56.33 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  51.18 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  53.75 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  54.36 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  50.97 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  56.05 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  47.93 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  51.57 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  47.43 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  54.36 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  49.37 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  53.29 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  50.32 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  49.03 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  49.68 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 292 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.05 
 
 		 183 aa  133  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.04 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  51.75 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  40.38 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.25 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.62 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  43.95 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  42.59 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.48 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 195 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  47.74 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  52.78 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.97 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>