27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3250 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  42.45 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  44.66 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  24.74 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  26.04 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  23.83 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  26.4 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  26.98 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  26.06 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  25.26 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  23.94 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  22.84 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  28.14 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  27.46 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  23.13 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  21.62 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  24.48 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  24.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  21.51 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  23.91 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0026  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  23.35 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>