More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3218 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3218  sugar transferase  100 
 
 
467 aa  934    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  50.24 
 
 
477 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.04 
 
 
498 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50 
 
 
482 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.58 
 
 
472 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  41.98 
 
 
505 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.19 
 
 
501 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.98 
 
 
516 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.11 
 
 
506 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  47.83 
 
 
510 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.74 
 
 
498 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  55.56 
 
 
478 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  43.17 
 
 
494 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.03 
 
 
506 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  49.75 
 
 
478 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  49.75 
 
 
478 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.11 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  32.78 
 
 
464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.08 
 
 
473 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.12 
 
 
517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.86 
 
 
461 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.18 
 
 
521 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50 
 
 
518 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  45.16 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50 
 
 
536 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.16 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  44.62 
 
 
512 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.77 
 
 
506 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.15 
 
 
520 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  44.49 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  41.9 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.42 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.1 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3176  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.23 
 
 
483 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2694  sugar transferase  46 
 
 
509 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335678  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3074  sugar transferase  48.92 
 
 
241 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.13 
 
 
488 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3330  sugar transferase  47.57 
 
 
254 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.669304  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.39 
 
 
461 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.33 
 
 
346 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1044  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.5 
 
 
501 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.0474242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  45.32 
 
 
457 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1171  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.75 
 
 
501 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1663  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.85 
 
 
516 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  41.13 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.5 
 
 
518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2659  sugar transferase  45.27 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  33.56 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2371  sugar transferase  47.18 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.93 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.33 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.34 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.14 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3938  sugar transferase  48.39 
 
 
245 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.15 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  48.73 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.27 
 
 
464 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.27 
 
 
464 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  44.44 
 
 
510 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  48.6 
 
 
508 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.73 
 
 
468 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.11 
 
 
454 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2376  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.97 
 
 
461 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  50.51 
 
 
484 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.62 
 
 
468 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.05 
 
 
506 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  44.33 
 
 
461 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.2 
 
 
471 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.1 
 
 
465 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  32.89 
 
 
469 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  31.8 
 
 
484 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.86 
 
 
477 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.92 
 
 
468 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.05 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.05 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.05 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.05 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3523  exopolysaccharide production protein  50 
 
 
226 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.05 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.52 
 
 
471 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.32 
 
 
461 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  42.36 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  45.33 
 
 
459 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  45.32 
 
 
460 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.75 
 
 
466 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.5 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  48.5 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  48.5 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>