More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3168 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.95 
 
 
309 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  75.65 
 
 
309 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.45 
 
 
314 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  65.47 
 
 
314 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
313 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.91 
 
 
308 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.59 
 
 
317 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.56 
 
 
309 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  63.31 
 
 
310 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.8 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.8 
 
 
309 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.42 
 
 
314 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  64.8 
 
 
309 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  65.58 
 
 
311 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.47 
 
 
309 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.75 
 
 
310 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.12 
 
 
308 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.58 
 
 
311 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 
309 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.75 
 
 
310 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.47 
 
 
309 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.47 
 
 
311 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
314 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.26 
 
 
311 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.79 
 
 
309 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.4 
 
 
310 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
312 aa  360  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.96 
 
 
309 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.96 
 
 
309 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.66 
 
 
309 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.13 
 
 
309 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
309 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.94 
 
 
311 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 
311 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.96 
 
 
349 aa  358  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.29 
 
 
311 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.87 
 
 
313 aa  358  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.29 
 
 
309 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.4 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.78 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.14 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.03 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.64 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.8 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.82 
 
 
319 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.99 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.51 
 
 
310 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.45 
 
 
309 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.67 
 
 
315 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.84 
 
 
314 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.39 
 
 
309 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.04 
 
 
317 aa  351  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.15 
 
 
310 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.97 
 
 
308 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.78 
 
 
310 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.19 
 
 
309 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.82 
 
 
309 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  60.75 
 
 
327 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.31 
 
 
309 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.94 
 
 
314 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.74 
 
 
309 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.62 
 
 
308 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.01 
 
 
308 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.15 
 
 
310 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.68 
 
 
310 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0147  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  61.69 
 
 
310 aa  346  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.02 
 
 
316 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.06 
 
 
308 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  64.47 
 
 
309 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  65.46 
 
 
309 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.18 
 
 
310 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.26 
 
 
308 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.34 
 
 
317 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  64.8 
 
 
309 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.51 
 
 
310 aa  344  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.17 
 
 
311 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.86 
 
 
310 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.14 
 
 
309 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.04 
 
 
310 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.45 
 
 
310 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.96 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.14 
 
 
313 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  63.84 
 
 
314 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.31 
 
 
309 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.04 
 
 
310 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.8 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>