162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3153 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 330 aa  665    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  58.9 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  53.17 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  42.77 
 
 		 358 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  45.24 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  43.07 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  42.9 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  37.16 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.46 
 
 		 640 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  37.8 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  32.85 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.99 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.98 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  37.35 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  37.43 
 
 		 639 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 624 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  36.17 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  35.17 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  34.2 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.39 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  34.32 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  32.95 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  35.28 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  35.14 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.53 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  32.84 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.2 
 
 		 368 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.72 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.72 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.72 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.27 
 
 		 631 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  36.28 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.72 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  35.88 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.28 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.75 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  40.06 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.88 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.22 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  36.16 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.75 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  35.38 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.89 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.9 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  34.26 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.08 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  35.77 
 
 		 374 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.26 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.19 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  31.35 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  35.71 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  34.17 
 
 		 370 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  34.4 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  33.63 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  33.63 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  35.05 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  34.62 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.66 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  34.81 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  37.76 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  29.28 
 
 		 325 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  32.94 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.61 
 
 		 365 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  31.82 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.43 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  33.63 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  31.53 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  31.53 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.01 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  31.07 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.88 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  29.28 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  28.66 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  31.73 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.44 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  33.91 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  31.06 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.58 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.99 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  31.53 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  31.07 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.31 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  31.64 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  34.91 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  29.63 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  30.23 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  30.23 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  30.86 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>