101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3122 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 380 aa  766    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  57.7 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  45.5 
 
 		 407 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  46.2 
 
 		 406 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  48.01 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  47.35 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  44.56 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  48.02 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  48.02 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  48.31 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  44.09 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  47.81 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  45.33 
 
 		 417 aa  298  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  43.9 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  49.21 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  46.13 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  44.3 
 
 		 421 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  47 
 
 		 420 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  43.19 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  45.18 
 
 		 418 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  47.02 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  41.32 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  40.55 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  46.69 
 
 		 417 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  44.16 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  40.42 
 
 		 471 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  41.69 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  41.64 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  40.91 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  45.71 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  43.98 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  46.67 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  46.03 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  46.35 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  38.6 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  41.04 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  41.01 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  40.21 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  35.5 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  39.52 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  38.73 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  38.73 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  33.45 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  36.96 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.81 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  36.01 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.07 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  37.05 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  29.75 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  32.64 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  35.87 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  35.04 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  34.48 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  31.88 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  34.94 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  31.07 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.79 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.35 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.7 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.7 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.09 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.62 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  28.52 
 
 		 312 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  32.26 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  28 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  27.33 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  25.24 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.09 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.68 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  28.43 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  27.17 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  22.37 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  28.03 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  23.18 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  24.26 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.09 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.56 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  26.11 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  21.26 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  24.68 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.5 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.27 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.27 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  20.66 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  20.88 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  21.82 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  25.94 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  25.59 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  26.11 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  23.92 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  24.54 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  24.54 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  24.54 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  22.26 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  25.66 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>