146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3089 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 416 aa  833    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  34.07 
 
 		 395 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.96 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  29.63 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.24 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  61.02 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  52.69 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  31.11 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  29.84 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  28.27 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  32.97 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  46.84 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  32.98 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  32.45 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  29 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  29.32 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  46.75 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  50.79 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  38.53 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  30.12 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  33.98 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  49.12 
 
 		 839 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  31.79 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  32.56 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  28.02 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  45.31 
 
 		 232 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  39.56 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  28.82 
 
 		 325 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  33.61 
 
 		 128 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  46 
 
 		 350 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>