More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3015 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  32 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  30.53 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  31.66 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0210  putative prophage repressor  31.98 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  30.85 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 115 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  31.4 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  31.4 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  33.01 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  34.06 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  27.2 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  30.05 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  33.51 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  29.25 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 62 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  32.11 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.47 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.44 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.35 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 111 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 111 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  29.38 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.85 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 459 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 388 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 108 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  49.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 123 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 334 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 102 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  30.41 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5184  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 1330 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 68 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 380 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  30.41 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  29.29 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  37 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 118 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 490 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1922  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 93 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 110 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 322 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 149 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 139 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 92 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 141 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 103 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 103 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 103 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  27.69 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 114 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  39.29 
 
 		 94 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  39.34 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.22 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>