213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2964 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  39.56 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 317 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  35.31 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  33.79 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  38.6 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  37.87 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 		 444 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 486 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 395 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 395 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  31.97 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  34.53 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.08 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  35.48 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  30.24 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  27.11 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.41 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  26.01 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.3 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.55 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.85 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  29.95 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  29.33 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.03 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.74 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 597 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  20.49 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1214  putative mobile metallo-beta-lactamase  22.98 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  27.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.34 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  43.86 
 
 		 763 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  43.86 
 
 		 763 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>