More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2945 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
509 aa  1046    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  67.21 
 
 
527 aa  696    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.5 
 
 
545 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  53.7 
 
 
545 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  52.35 
 
 
527 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.29 
 
 
526 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  52.35 
 
 
527 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  51.19 
 
 
540 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  52.35 
 
 
527 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  52.39 
 
 
538 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 
536 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  51.12 
 
 
527 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  50.92 
 
 
527 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  51.45 
 
 
538 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  49.6 
 
 
539 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  50.32 
 
 
513 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  49.48 
 
 
519 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  47.42 
 
 
540 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  46.58 
 
 
537 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  43.47 
 
 
537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  45.54 
 
 
536 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 
535 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  44.86 
 
 
537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  45.35 
 
 
536 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  43.87 
 
 
535 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 
520 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
525 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
519 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  35.49 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 
522 aa  299  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  34.68 
 
 
529 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  34.88 
 
 
529 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
529 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
535 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  35 
 
 
535 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  33.61 
 
 
518 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  34.06 
 
 
527 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  32.06 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  34.11 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 
534 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 
529 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  31.6 
 
 
496 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
534 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 
512 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  32.48 
 
 
532 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.75 
 
 
516 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
511 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 
538 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.46 
 
 
516 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
513 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
523 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 
503 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
555 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
533 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
517 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
550 aa  151  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
502 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
517 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28 
 
 
532 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
527 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 
513 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 
514 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
561 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  26.07 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.3 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  30.63 
 
 
510 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.83 
 
 
509 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
508 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
543 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 
495 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
534 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.57 
 
 
521 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.57 
 
 
521 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
521 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.57 
 
 
521 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
510 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
519 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.36 
 
 
535 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
527 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.62 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.36 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
502 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.95 
 
 
505 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
535 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  24.85 
 
 
514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>