246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2898 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  54.52 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  52.96 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  38.97 
 
 		 456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  38.61 
 
 		 512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  38.61 
 
 		 486 aa  269  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  40 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  43.27 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  37.01 
 
 		 459 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  39.44 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  34.52 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  35.81 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  37.94 
 
 		 448 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  39.33 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  41.82 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  36.18 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  40.95 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  38.53 
 
 		 531 aa  246  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  38.03 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  33.88 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  33.08 
 
 		 417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  37.36 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  36.97 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  37.17 
 
 		 443 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  36.67 
 
 		 554 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  40.36 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  38.25 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  31.8 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  36 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.31 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  33.15 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  38.94 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  33.52 
 
 		 402 aa  220  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  40.65 
 
 		 374 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  38.08 
 
 		 366 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  35.29 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  32.6 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  32.6 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  32.4 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  32.4 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  40.27 
 
 		 446 aa  213  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  33.55 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  31.96 
 
 		 545 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  37.42 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  31.91 
 
 		 537 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  35.19 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  31.57 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  36.83 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  31.57 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  30.77 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  31.57 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  37.22 
 
 		 419 aa  203  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  31.36 
 
 		 519 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  31.36 
 
 		 519 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  34.04 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  34.04 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  34.04 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  34.04 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  34.04 
 
 		 476 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  30.8 
 
 		 518 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  31.58 
 
 		 448 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.26 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  36.36 
 
 		 498 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  37.54 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  36.14 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  27.33 
 
 		 531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  29.41 
 
 		 518 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  34.55 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  34.55 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  34.55 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  26.31 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  30.99 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  38.89 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  36.05 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  34.2 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  33.79 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  31.49 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.82 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  30.33 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  34.29 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  36.14 
 
 		 391 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  29.14 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  30.74 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  30.34 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  33.5 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  33.51 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  31 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  32 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  29.53 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  32.75 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  30.9 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>