More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2823 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  100 
 
 		 422 aa  849    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  71.26 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  59.61 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  49.38 
 
 		 445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  47.1 
 
 		 444 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  41.11 
 
 		 430 aa  315  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  41.09 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  38.77 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  39.25 
 
 		 405 aa  278  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.61 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  38.24 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.92 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  42.89 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  35.63 
 
 		 428 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  37.96 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  37.09 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  37.04 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  37.26 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  35.1 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.03 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.98 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.6 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  36.34 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.78 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  36.12 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  37.86 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  35.15 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  34.87 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  38.68 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  36.73 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.18 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  35.38 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  36.64 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.57 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.7 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.74 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.01 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  35.27 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  35.27 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  35.27 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  36.98 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.85 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  34.39 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  34.39 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  34.39 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  34.05 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  34.86 
 
 		 404 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.71 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.31 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.94 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.66 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.62 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  33.84 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  34.94 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.84 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  33.17 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.44 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  35.54 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.65 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.83 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.17 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.77 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.53 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.61 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.37 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.61 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.37 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.98 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.81 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.5 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  30.84 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.02 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  29.95 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.26 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.16 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.8 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.53 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  29.95 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.45 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30.66 
 
 		 486 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.33 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  32.63 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.13 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  31.35 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  29.58 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.88 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.13 
 
 		 478 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  29.6 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.54 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.53 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  29.54 
 
 		 423 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  29.54 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.48 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  29.36 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  32.42 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  29.06 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.43 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  31.75 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.02 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>