71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2704 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.93 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.16 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  30.4 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.52 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.75 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.92 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.58 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  41.05 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.32 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  35.57 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  31.17 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.54 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  45.24 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.3 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  25.74 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  25.74 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  30 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.24 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  27.6 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  29.55 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  31.88 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  33.33 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.76 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2385  putative phage repressor  32.93 
 
 		 130 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  25.62 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  27.54 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.83 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  26.09 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.43 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.56 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.79 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.13 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  26.7 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.96 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.16 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  39.06 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  24.89 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.34 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  29.41 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  39.19 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.83 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  24.27 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  29.29 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.55 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  26.94 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  28.12 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.3 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  31.03 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  34.04 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.55 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  32.62 
 
 		 216 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.23 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.67 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30.84 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.95 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.12 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.59 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  28.17 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.89 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  29.59 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  31.87 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  27.01 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>