More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2683 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  73.95 
 
 		 430 aa  663    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  868    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  79.25 
 
 		 429 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  89.28 
 
 		 429 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 430 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  70.53 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 		 430 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  70.77 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 430 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  70.53 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  68.37 
 
 		 448 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  69.77 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  68.19 
 
 		 437 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  68.14 
 
 		 430 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  68.14 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.85 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  69.07 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  66.9 
 
 		 432 aa  594  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  67.75 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  67.21 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  66.05 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  67.83 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  65.74 
 
 		 432 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  67.36 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  65.27 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 		 432 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  65.27 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  65.19 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  64.87 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 		 448 aa  581  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  64.02 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  65.19 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  64.49 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  63.32 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  60.61 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.63 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  53.94 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  56.97 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1564  Adenylosuccinate synthase  56.97 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  52.08 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  54.8 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  54.8 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  54.8 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  54.33 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.82 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  54.33 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  52.12 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  54.57 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.26 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  52.07 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.14 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  52.52 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>