More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2601 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 789 aa  1612    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  71.56 
 
 		 789 aa  1111    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 743 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  34.22 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 779 aa  332  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 774 aa  331  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 782 aa  331  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 773 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 764 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 729 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 763 aa  248  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 759 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 756 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 767 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 755 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 746 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 722 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 771 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 764 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 765 aa  230  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 743 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 761 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 717 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 748 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 704 aa  221  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 743 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 730 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 794 aa  218  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 726 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 761 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 747 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 758 aa  208  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 741 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 777 aa  203  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 755 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 777 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 739 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 785 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 822 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 779 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 780 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 863 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 695 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 780 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 796 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.19 
 
 		 747 aa  197  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 784 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 731 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 735 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 783 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 758 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.16 
 
 		 797 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 790 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 737 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 753 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 790 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 783 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 725 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 764 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 766 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 700 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 862 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 773 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 733 aa  187  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 769 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 755 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 744 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 776 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 867 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 731 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 775 aa  184  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 780 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 720 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 749 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 784 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 810 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 741 aa  180  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 757 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 808 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 786 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 817 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 763 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 773 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 771 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 758 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 794 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>