More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2600 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  705    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 353 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  24.64 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  27.09 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  25.54 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.07 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.35 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  27.3 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  25.9 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.51 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  23.49 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  28.35 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>