More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2581 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  44.3 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  41.67 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.83 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.2 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  37.28 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.42 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.54 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.54 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.62 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.62 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.4 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  36.23 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.23 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2572  crpK, Fnr-type transcriptional regulator  36.26 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1230  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1951  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.19 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  34.45 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  34.57 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.57 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.13 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  34.57 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  34.57 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.51 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.09 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.36 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  34.59 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  34.04 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  32.03 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  32.03 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  32.03 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  34.04 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  32.45 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  31.17 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.87 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.2 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>