155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2579 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2579  OmpW  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  57.97 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  36.24 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  37.96 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  37.88 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  34 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  34 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  34.1 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  31.14 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  37.28 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  34.06 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  34.45 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  33.99 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  31.47 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  35.29 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  33.5 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  34.5 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  30.45 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  31.37 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  28.57 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.09 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.52 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  30.29 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  29.68 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  31.6 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  35.15 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.78 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  32.47 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  32.47 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  31.06 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  32.03 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  32.35 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  32.12 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  33.33 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  31.6 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  27.66 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  32.12 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  34.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  30.32 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.15 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.15 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  32.33 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  29.96 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  33.53 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  27.98 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  29.65 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.6 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.54 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  29.65 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  27.98 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.86 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  33.73 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  33.13 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  32.39 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.19 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  27.65 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  29.09 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  29.83 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  30.26 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  31.22 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  28.34 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  31.22 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  31.22 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  31.22 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  31.22 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  31.22 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  34.15 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  27.11 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28.14 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  27.48 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  25.73 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.73 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25.21 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  26.94 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  27.23 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.71 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.71 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  25.11 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  30.69 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  28.24 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  30.86 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  25.78 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.9 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  27.73 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  25.48 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  30.81 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  28.74 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  26.81 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  26.01 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  28.65 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  24.24 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  25.86 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  31.4 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  27.88 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>