More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2569 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
449 aa  911    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  53.49 
 
 
437 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
450 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  41.41 
 
 
449 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.78 
 
 
450 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 
451 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 
490 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  41.41 
 
 
449 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 
470 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.26 
 
 
441 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 
454 aa  309  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 
444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
444 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  41.12 
 
 
450 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 
469 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 
450 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  41.8 
 
 
480 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  40.24 
 
 
450 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.56 
 
 
456 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 
452 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.24 
 
 
467 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 
448 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.64 
 
 
454 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 
444 aa  285  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
452 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 
470 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 
451 aa  279  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  38.05 
 
 
460 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  37.82 
 
 
460 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
464 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 
464 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
451 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 
451 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 
452 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 
460 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 
460 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  37.03 
 
 
461 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 
460 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
471 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.42 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 
460 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 
460 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
465 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.78 
 
 
465 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 
482 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 
463 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.78 
 
 
465 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 
460 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.91 
 
 
469 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.71 
 
 
462 aa  270  5e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  32.51 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
483 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
462 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  35.58 
 
 
494 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  35.58 
 
 
494 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 
510 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  36.74 
 
 
465 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.64 
 
 
478 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
481 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
481 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.28 
 
 
470 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 
461 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  35.39 
 
 
481 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
483 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
483 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.85 
 
 
458 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  36.01 
 
 
455 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 
450 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
483 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
465 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 
460 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 
460 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 
460 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  34.41 
 
 
453 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.19 
 
 
457 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.51 
 
 
468 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 
450 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  35.03 
 
 
458 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  34.93 
 
 
463 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 
455 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>