More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2566 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  100 
 
 
366 aa  738  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  48.13 
 
 
347 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  43.89 
 
 
346 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  42.17 
 
 
384 aa  266  3e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  41.43 
 
 
368 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
347 aa  183  4e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.64 
 
 
332 aa  172  8e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.23 
 
 
337 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 
350 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  32.71 
 
 
351 aa  167  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
350 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 
351 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  31.89 
 
 
350 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  31.89 
 
 
350 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.61 
 
 
346 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 
371 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 
333 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
335 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.86 
 
 
350 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.73 
 
 
335 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.73 
 
 
335 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 
336 aa  148  1e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.68 
 
 
346 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 
350 aa  142  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.16 
 
 
325 aa  139  5e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.23 
 
 
354 aa  139  8e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.59 
 
 
352 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.18 
 
 
330 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.38 
 
 
330 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  30.12 
 
 
346 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 
330 aa  136  6e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.62 
 
 
341 aa  136  6e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  31.27 
 
 
338 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.18 
 
 
330 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.4 
 
 
355 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.46 
 
 
337 aa  135  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.82 
 
 
346 aa  134  2e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.21 
 
 
335 aa  135  2e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.86 
 
 
334 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.86 
 
 
334 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 
332 aa  132  1e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.41 
 
 
330 aa  132  1e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  30.99 
 
 
352 aa  132  1e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  31.17 
 
 
356 aa  129  8e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  28.88 
 
 
351 aa  129  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 
332 aa  129  1e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.8 
 
 
345 aa  128  1e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  28.88 
 
 
351 aa  129  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.53 
 
 
331 aa  129  1e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  28.88 
 
 
351 aa  128  2e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  31.54 
 
 
337 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  31.17 
 
 
356 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.57 
 
 
351 aa  127  4e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 
341 aa  127  4e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  36.32 
 
 
256 aa  125  8e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.77 
 
 
351 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  31.14 
 
 
341 aa  122  1e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.18 
 
 
352 aa  122  1e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
355 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.53 
 
 
359 aa  120  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 
362 aa  119  8e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 
346 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
324 aa  112  1e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.2 
 
 
509 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 
335 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.87 
 
 
531 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
771 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.46 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
660 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.59 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 
544 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 
393 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  33.59 
 
 
252 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
544 aa  90.1  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 
397 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 
542 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 
339 aa  87  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
674 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
668 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.28 
 
 
648 aa  85.1  2e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.53 
 
 
376 aa  85.1  2e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  28.23 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  24.12 
 
 
773 aa  83.2  6e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.7 
 
 
386 aa  83.2  7e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
364 aa  82.8  9e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.06 
 
 
182 aa  82.8  9e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 
345 aa  82.4  1e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 
359 aa  82.8  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.09 
 
 
335 aa  82.4  1e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  29.37 
 
 
339 aa  82  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
364 aa  81.6  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 
549 aa  81.3  2e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  28.08 
 
 
368 aa  81.6  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 
369 aa  80.9  3e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 
656 aa  80.9  3e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
662 aa  80.5  4e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>