More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2529 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  90.16 
 
 		 122 aa  221  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  88.52 
 
 		 122 aa  216  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  197  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  78.69 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  78.69 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  80.33 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  78.69 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  78.69 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 		 125 aa  181  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 		 123 aa  169  7.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  67.48 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 125 aa  163  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  64.96 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  59.5 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  64.96 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  154  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  61.16 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  61.02 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  150  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2152  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000893121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>