More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2525 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  54.16 
 
 
714 aa  749    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
711 aa  1439    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  58.59 
 
 
719 aa  782    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  56.16 
 
 
710 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  47.55 
 
 
745 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  44.64 
 
 
719 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  44.43 
 
 
689 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  43.98 
 
 
688 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  44.1 
 
 
730 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  47 
 
 
682 aa  579  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  42.66 
 
 
724 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  42.88 
 
 
719 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  43.98 
 
 
723 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  42.46 
 
 
703 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  44.54 
 
 
713 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 
718 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  43.67 
 
 
689 aa  571  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  42.88 
 
 
708 aa  572  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  46.42 
 
 
685 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  42.55 
 
 
700 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 
695 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  43.33 
 
 
685 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  40.91 
 
 
688 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  40.91 
 
 
688 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  42.86 
 
 
727 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  42.71 
 
 
727 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  44.66 
 
 
696 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  41.97 
 
 
726 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  42.71 
 
 
727 aa  552  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  42.71 
 
 
727 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  42.26 
 
 
729 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  41.35 
 
 
727 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  41.63 
 
 
727 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  41.77 
 
 
727 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  43.6 
 
 
701 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  40.7 
 
 
718 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  43.52 
 
 
703 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  40.48 
 
 
714 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  41.2 
 
 
718 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  42.42 
 
 
677 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  42.19 
 
 
679 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  43.33 
 
 
685 aa  528  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  40.9 
 
 
719 aa  528  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  39.31 
 
 
670 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  39.5 
 
 
726 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.05 
 
 
740 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  39.66 
 
 
713 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  37.48 
 
 
703 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  37.84 
 
 
690 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  40.29 
 
 
692 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  33.8 
 
 
707 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  33.89 
 
 
719 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  39.42 
 
 
690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  37.45 
 
 
697 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  37.82 
 
 
723 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  38.03 
 
 
709 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.37 
 
 
1283 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  36.74 
 
 
666 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  37.01 
 
 
705 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  36.77 
 
 
702 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  37.88 
 
 
742 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.7 
 
 
704 aa  362  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  37.32 
 
 
717 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  34.11 
 
 
686 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  33.1 
 
 
705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  31.78 
 
 
733 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  30.63 
 
 
690 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
718 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  27.41 
 
 
734 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  27.85 
 
 
704 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  36.99 
 
 
696 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
811 aa  238  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.17 
 
 
697 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  35.44 
 
 
701 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  40.88 
 
 
697 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  36 
 
 
696 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.92 
 
 
682 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  44.79 
 
 
697 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  28.45 
 
 
678 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  29.34 
 
 
686 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  27.96 
 
 
803 aa  231  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.78 
 
 
689 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  44.4 
 
 
697 aa  231  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  44.79 
 
 
697 aa  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  44.02 
 
 
697 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  44.02 
 
 
697 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  44.02 
 
 
697 aa  230  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  29.23 
 
 
680 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  42.86 
 
 
695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  31.71 
 
 
696 aa  227  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  40.82 
 
 
710 aa  227  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  30.35 
 
 
683 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  29.78 
 
 
680 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  29.75 
 
 
683 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  37.43 
 
 
681 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  29.64 
 
 
680 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  42.27 
 
 
734 aa  224  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  28.39 
 
 
677 aa  224  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>