63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2491 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  60.27 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  53.95 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  40.81 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  41.11 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  38.12 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  34.1 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  34.91 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  34.91 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  34.43 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  35.27 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  37.75 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  35.75 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  34.02 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  33.94 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  34.27 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  32.18 
 
 		 202 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  33.5 
 
 		 206 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  34.72 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  32.3 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  31.96 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  32.65 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  30.69 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  32.5 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  32.14 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  31.63 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  31.63 
 
 		 200 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  31.28 
 
 		 194 aa  85.1  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  25.64 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  32.41 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  30.66 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  29.86 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  30.57 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  31.46 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  30.32 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  26.61 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  30.25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  32.5 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27.41 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  31.9 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  26.67 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  26.11 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  28.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  26.73 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  37.88 
 
 		 88 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  32.86 
 
 		 94 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.67 
 
 		 93 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 96 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  33.72 
 
 		 91 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.56 
 
 		 105 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  28.57 
 
 		 95 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  36.49 
 
 		 96 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.68 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  31.63 
 
 		 98 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  47.83 
 
 		 95 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>